allèles PI (classe B)
Par sbreuil
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Dernière modification
05/10/2015 15:00
Séquences du cadre de lecture et de la protéine correspondante
pour les allèles sauvage, pi-1, pi-3 et pi-5 du gène PISTILLATA (PI)
alleles PI.txt
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Fichier texte,
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Contenu du fichier
; Anag�ne - Fen�tre Edition ; ; Type 0 ; Dec 0 ; Diff�rents all�les de PISTILLATA ;- ; all�le normal ; Type 1 ; Dec 0 ; ORF du g�ne de classe B PISTILLATA d'Arabidospis thaliana - - GeneID:832146-TAIR:AT5G20240.1 ; ATGATGGGTAGAGGAAAGATCGAGATAAAGAGGATAGAGAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGATTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACAGTTCTTTGTGATGCAAAAGTTGCCCTCATAATCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGATTGATTACTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTTAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAGGGAGAAGATATACAGTCTCTCAACTTGAAAAATCTGATGGCTGTCGAGCACGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGATCCTTATATCAAAGAGGAGAAATGAGAAGATGATGGCGGAGGAGCAACGGCAACTCACTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCAAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGAGATCATGATGGGCAGTTTGGATATAGAGTGCAACCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATTGA ;- ; prot�ine normale ; Type 3 ; Dec 0 ; s�quence de la prot�ine cod�e par le g�ne de classe B PISTILLATA d'Arabidospis thaliana - GeneID:832146-TAIR:AT5G20240.1 ; MGRGKIEIKRIENANNRVVTFSKRRNGLVKKAKEITVLCDAKVALIIFASNGKMIDYCCPSMDLGAMLDQYQKLSGKKLWDAKHENLSNEIDRIKKENDSLQLELRHLKGEDIQSLNLKNLMAVEHAIEHGLDKVRDHQMEILISKRRNEKMMAEEQRQLTFQLQQQEMAIASNARGMMMRDHDGQFGYRVQPIQPNLQEKIMSLVID ;- ; all�le pi-1 ; Type 1 ; Dec 0 ; Mutant EMS (EthylM�thylSulfonate) ; substitution ; all�le fort ; S.BREUIL INRP d'apr�s GOTO, K. et Meyerowitz, E. 1992 ; ATGATGGGTAGAGGAAAGATCGAGATAAAGAGGATAGAGAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGATTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACAGTTCTTTGTGATGCAAAAGTTGCCCTCATAATCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGATTGATTACTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGAGATGCTAAGCATGAGAACCTTAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAGGGAGAAGATATACAGTCTCTCAACTTGAAAAATCTGATGGCTGTCGAGCACGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGATCCTTATATCAAAGAGGAGAAATGAGAAGATGATGGCGGAGGAGCAACGGCAACTCACTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCAAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGAGATCATGATGGGCAGTTTGGATATAGAGTGCAACCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATTGA ;- ; prot�ine PI-1 ; Type 3 ; Dec 0 ; Mutant EMS (EthylM�thylSulfonate) ; non sens ; prot�ine non foctionnelle ; S.BREUIL INRP d'apr�s GOTO, K. et Meyerowitz, E. 1992 ; MGRGKIEIKRIENANNRVVTFSKRRNGLVKKAKEITVLCDAKVALIIFASNGKMIDYCCPSMDLGAMLDQYQKLSGKKL ;- ; ADNc pi-3 ; Type 1 ; Dec 0 ; Mutant EMS (EthylM�thylSulfonate) ; substitution ; all�le fort ; S.BREUIL INRP d'apr�s Hill, J.P. and Lord, E.M. 1989 ; ATGATGGGTAGAGGAAAGATCGAGATAAAGAGGATAGAGAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGATTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACAGTTCTTTGTGATGCAAAAGTTGCCCTCATAATCTTTGTAAGTAATGGTAAGATGATTGATTACTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTTAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAGGGAGAAGATATACAGTCTCTCAACTTGAAAAATCTGATGGCTGTCGAGCACGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGATCCTTATATCAAAGAGGAGAAATGAGAAGATGATGGCGGAGGAGCAACGGCAACTCACTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCAAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGAGATCATGATGGGCAGTTTGGATATAGAGTGCAACCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATTGA ;- ; prot�ine PI-3 ; Type 3 ; Dec 0 ; Mutant EMS (EthylM�thylSulfonate) ; faux-sens ; prot�ine non fonctionnelle ; S.BREUIL INRP d'apr�s . Hill, J. P. and Lord, E. M. 1989 ; MGRGKIEIKRIENANNRVVTFSKRRNGLVKKAKEITVLCDAKVALIIFVSNGKMIDYCCPSMDLGAMLDQYQKLSGKKLWDAKHENLSNEIDRIKKENDSLQLELRHLKGEDIQSLNLKNLMAVEHAIEHGLDKVRDHQMEILISKRRNEKMMAEEQRQLTFQLQQQEMAIASNARGMMMRDHDGQFGYRVQPIQPNLQEKIMSLVID ;- ; ADNc pi-5 ; Type 1 ; Dec 0 ; Mutant EMS (EthylM�thylSulfonate) ; substitution ; all�le faible ; S.BREUIL INRP d'apr�s Hongjun Xiang-639E1 ; ATGATGGGTAGAGGAAAGATCGAGATAAAGAGGATAGAGAACGCAAACAACAGAGTGGTGACGTTCTCAAAGAGGAGGAATGGATTGGTGAAGAAGGCTAAAGAGATCACAGTTCTTTGTGATGCAAAAGTTGCCCTCATAATCTTTGCAAGTAATGGTAAGATGATTGATTACTGTTGTCCTTCCATGGATCTTGGTGCTATGTTGGACCAATACCAGAAGTTATCTGGCAAGAAACTATGGGATGCTAAGCATGAGAACCTTAGCAATGAGATTGATAGGATCAAGAAAGAGAATGATAGCTTACAACTGGAGCTCAGGCATTTGAAGGGAGAAGATATACAGTCTCTCAACTTGAAAAATCTGATGGCTGTCAAGCACGCCATTGAACATGGCCTCGACAAAGTCCGAGACCACCAGATGGAGATCCTTATATCAAAGAGGAGAAATGAGAAGATGATGGCGGAGGAGCAACGGCAACTCACTTTCCAGCTGCAACAACAGGAGATGGCTATAGCAAGCAACGCAAGAGGAATGATGATGAGAGATCATGATGGGCAGTTTGGATATAGAGTGCAACCGATTCAGCCAAATCTTCAGGAAAAGATTATGTCTTTGGTCATCGATTGA ;- ; prot�ine PI-5 ; Type 3 ; Dec 0 ; Mutant EMS (EthylM�thylSulfonate) ; faux-sens ; prot�ine partiellement fonctionnelle (p�tales transform�es en s�pales mais �tamines normales) ; S.BREUIL INRP d'apr�s Hongjun Xiang-639E1 ; MGRGKIEIKRIENANNRVVTFSKRRNGLVKKAKEITVLCDAKVALIIFASNGKMIDYCCPSMDLGAMLDQYQKLSGKKLWDAKHENLSNEIDRIKKENDSLQLELRHLKGEDIQSLNLKNLMAVKHAIEHGLDKVRDHQMEILISKRRNEKMMAEEQRQLTFQLQQQEMAIASNARGMMMRDHDGQFGYRVQPIQPNLQEKIMSLVID ;-