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Description des modèles

Par Anne Florimond Dernière modification 01/10/2015 14:35
Descriptif des entités utilisées pour la modélisation de l'expérience référente (modèle "souris2injGRM.nbd") et pour la modélisation du processus de construction de la mémoire immunitaire (modèle "constructionmemoire.nbd")

 "Souris et GRM - deux injections":

Modèle souris2injGRM.nbd

Avec ce modèle, il s'agit de reproduire les conditions de l'expérience référente, tout en simplifiant le protocole : d'une part l'utilisateur ne dispose que d'une seule souris ; d'autre part l'évolution du nombre de plasmocytes est directement visualisable et quantifiable sans que des prélévements de rate ne soient nécessaires. Dans ce modèle, 100 tics représentent une durée de 2 jours.

Description des entités composant ce modèle :

Nom

Description
Entités visibles dans le panel

 GRMinj1

 antigène (GRM)  injecté lors de la première injection

 GRMinj2

 antigène (GRM) injecté lors de la deuxième injection

 LBspé

 lymphocyte B spécifique des GRM

 LBnonspé

 lymphocyte B non spécifique des GRM

 plasmocyte

 plasmocyte sécréteur d'anticorps anti-GRM  

  Ac

anticorps anti-GRM

  Entités non visibles dans le panel (l'identification sera toutefois possible à l'aide du clic droit lors de la simulation)

 LBa

lymphocyte B activé à la suite de la rencontre avec un GRM

anonyme

lymphocyte B mémoire

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 "Cellules immunitaires et antigène - deux rencontres"

Modèle constructionmémoire.nbd

Avec ce modèle fonctionnel, il est possible d'observer, à l'échelle des populations cellulaires, les mécanismes de la construction d'une mémoire immunitaire.

Il s(agit d'injecter un antigène (deux possibilités) au temps zéro et provoquer ainsi une réponse immunitaire primaire, puis d'injecter un antigène après la fin de cette réponse afin de provoquer une réponse immunitaire secondaire.

 Description des entités composant ce modèle :

Nom

Description

Entités visibles dans le panel

 LB1naïf, LB2naïf

 lymphocytes B appartenant à deux clones différents, spécifiques respectivement des antigènes 1 et 2, et n'ayant jamais rencontré l'antigène

 LT4-1naïf, LT4-2naïf

 lymphocytes T4 appartenant à deux clones différents, spécifiques respectivement des antigènes 1 et 2, et n'ayant jamais rencontré l'antigène

LT8-1naïf, LT8-2naïf

 lymphocytes T8 appartenant à deux clones différents, spécifiques respectivement des antigènes 1 et 2, et n'ayant jamais rencontré l'antigène

ag1rencontre1,ag2rencontre1, ag1rencontre2, ag2rencontre2

 deux antigènes différents ; "rencontre 1" désigne le cas où les cellules immunitaires rencontrent pour la première fois cet antigène et "rencontre 2" désigne la deuxième rencontre des cellules avec un antigène (le cas où les cellules immunitaires le rencontrent pour la deuxième fois.)

 LB1m, LB2m

 lymphocytes B mémoire spécifiques respectivement des antigènes 1 et 2

 LT4-1m, LT4-2m

 lymphocytes T4 mémoire spécifiques respectivement des antigènes 1 et 2

LT8-1m, LT8-2m

lymphocytes T8 mémoire spécifiques respectivement des antigènes 1 et 2

plasmocyte

plasmocyte sécréteur d'anticorps

LTc

lymphocyte T cytotoxique

Entités non visibles dans le panel (l'identification sera toutefois possible à l'aide du clic droit lors de la simulation)

LB1a et LB2a

LT4-1a et LT4-2a

LT8-1a et LT8-2a

 lymphocytes B ou lymphocytes T4 ou lymphocytes T8 activés par la rencontre avec l'antigène

LT4-1h, LT4-2h

Lymphocyte T4 activé sécréteur d'interleukine

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