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Banque de données Sepkoski

La banque de données de Sepkoski correspond à une compilation de données sur plus de 30 000 genres de  fossiles au niveau mondial. Effectuée dans les années 1970, elle reste la référence pour l'étude de la paléobiodiversité.

Cette base de données a été publiée sur Internet par Shanan Peters  (2002) et est actuellement maintenue et accueillie par lui à l' University of Michigan

Un moteur permet d'interroger la base et d'afficher les données concernant un genre ou un embranchement.

 Ces données sont présentées sous forme d'une page html et de permettent pas immédiatment de traitements graphiques pour un travail pédagogique avec des élèves.

 Nous avons donc repris la totalité des données de Sepkoski  téléchargeables  sur le site de Donald Kenney sous forme texte et avons formaté les données pour permettre le traitement.

 Accès aux fichiers

 

Regroupements par étage

De nombreux étages sont subdivisés en supérieur, moyen inférieur. Nous avons regroupé l'ensemble avec les datations correspondant à l'étage

Divisions présentes Siginification Regroupement
K ceno Cenomanian Cenomanian
K ceno-u Upper-Cenomanian
K ceno-m Middle-Cenomanian
K ceno- l Lower-Cenomanian

 

Dans certains cas, lorsque nous possédions une datation fiable, nous avons gardé les sous divisions. C'est le cas pour le miocène et pour le cambrien moyen

 Divisions présentes  Siginification  Regroupement
T.Mi-u Upper Miocene Miocene sup.
T.Mi-u-u Messinian
T.Mi-u-l Tortonian
T.Mi-m Middle Miocene Miocene Moyen
T.Mi-m-u Serravalian
T.Mi-m-l Langhian
T.Mi-l Lower Miocene Miocene inf.
T.Mi-l-u Burdigalian
T.Mi-l-l Aquitanian
     
Cm.uMid Upper Middle Cambrain   Cambrien moyen sup.
Cm.uMid-u Upper Up-Mid Cambrian
 Cm.uMid-m Middle Up-Mid Cambrian 
 Cm.uMi-l Lower Up-Mid Cambrian 
Cm.mMid Middle Middle Cambrian   Cambrien moyen moyen
 Cm.mMid Upper Mid-Middle Cambrian 
 Cm.mMid Middle Mid-Middle Cambrian 
 Cm.mMid Lower Mid-Middle Cambrian 
Cm.lMid Lower Middle Cambrian    Cambrien moyen inf.
Cm.lMid-u  Upper Low-Mid Cambrian
 Cm.lMi-l Lower Low-Mid Cambrian

 

 

Regroupement des étages à dénomination particulière.

Les échelles stratigraphiques utilisées pour dater les fossiles sont parfois avec des dénominations locales. Voici les correspondances que nous avons adoptées.

 

 Divisions présentes  Signification

 Apparitions fusionnées avec

(Nb de lignes concernées)

 Tr.olen

 Olenekian (202;139)

 
Trias inf.

 

 Tr.Nm

 Nammalian (17;15)

 Tr.Indu

 Induan (48;58)

 P.Dora

 Dorashamian (67;258)

 
Tatatian
 P.Djhu

 Djhulfian (69;183)

 P.Wc  Wolfcampian(42,70)

 Sakmarian

 

  Suppression des données datées de manière trop imprécises

 Certains fossiles sont datés de manière imprécise quant à leur date d'apparition ou de disparition. Voici le récapitulatif des suppressions que nous avons effectués.

 Divisions présentes  Signification Total de lignes supprimées    Divisions présentes  Signification Total de lignes supprimées
R? Recent 41  
Tr.l
Lower Triassic 107
T? Tertiary 30  
P?
Permian 34
T.Ng Neogene 18  
P.u
Upper Permian 103
T.Mi Miocene 791  
P.l
Lower Permian 151
T.Pg Paleogene 23  
C?
Carboniferous 30
T.Ol Oligocene 195  
C.u
Upper Carboniferous 74
T.Eo Eocene 517  
C.Pn
Pennsylvanian 65
T.Eo-m Middle Eocene 376  
C.l
Lower Carboniferous 127
T.Pale Paleocene 77  
C.Ms
Mississipian 54
K? Cretaceous 45  
D?
Devonian 29
K.u Upper Cretaceous 441  
D.u
Upper Devonian 87
K.Sn Senonian    
D.m
Middle Devonian 161
K.m Gallic 18  
D.l
Lower Devonian 215
K.l Lower Cretaceous 144  
S?
Silurian
44
K.Nc Neocomian 104  
S.u
Upper Silurian 116
J? Jurassic 55  
O?
Ordovician 31
J.u Upper Jurassic 234  
O.u
Upper Ordovician 131
J.m Middle Jurassic 93  
O.m
Middle Ordovician 132
J.l Lower Jurassic 107  
O.l
Lower Ordovician 125
Tr? Triassic 35  
Cm?
Cambrian 20
Tr.u Upper Triassic 111  
Cm.u
Upper Cambrian 115
Tr.m Middle Triassic 93  
Cm.m
Middle Cambrian 128
       
Cm.l
Lower Cambrian 114

 Soit au total environ 6000 lignes supprimées sur un fichier de 36000.

Datation des étages

 

 Nous avons utilisé pour dater les étages une publication faite sur Nature actualisé en 2002 et disponible en ligne .

Ces datations ne correspondent pas parfaitement avec celles utilisées dans la banque de données Benton et le fichier ci-joint récapitule les différences étage par étage.

Cet exemple peut être utilisé pour faire comprendre la différence entre les datations relatives  (étages ) et la datations isotopiques associées.

 

Téléchargement des fichiers (au format xls)

 

  • Ensemble de la banque (fichier compressé de 0,8 Mo)

 

Phyla:

       

 

   Analyse phylum par phylum

Analyse par  classes

Actinopoda

Annelida

Arthropoda

Brachiopoda

Bryozoa

Chordata

Cnidaria


Echinodermata

Hemichordata

Hyolitha

Mollusca

Porifera

 

Licence creative commons version 3.0 :

http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/deed.fr

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