Comparaison des génomes
Par Hervé Levesque
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Dernière modification
04/07/2016 10:34
Une activité d'exploitation des bases de données génomiques appliquée à l'étude des génomes d'organismes procaryotes thermophiles et mésophiles
- données sur les génomes, fichier ou accès en ligne : taille, nombre total de gènes, nombre de gènes des ARN ribosomiques, nombre de gènes des ARNt, %G+C
- on sélectionne (si dèjà fait) ou constitue (à faire durant l'activité) une collection d'espèces thermophiles et une collection d'espèces mésophiles (il faut pour cela disposer des Topt de chaque espèce et croiser les fichiers)
- on opère l'analyse (une fiche-questionnaire avec des consignes pour accompagner la démarche : combien d'organismes étudiés, quel groupes taxonomiques, taille moyenne des génomes par catégorie, nb moyen de gènes totaux, d'ARNr, d'ARNt, etc.)