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Ressources bioinformatiques

Par Hervé Levesque — Dernière modification 04/07/2016 10:34
Les liens vers les bases de données, les logiciels et les outils d'analyse en ligne pour les biomolécules

Inventaire des ressources identifiées.

Pour interroger en ligne sur les températures de croissance des microorganismes (minimum, optimum, maximum) :

  1. Dans le bandeau de gauche "cliquer" à l'aide de la "souris" sur search,
  2. Sur l'écran de travail (partie supérieure), "cocher" sur genus et saisir le nom de genre de l'espèce pour laquelle l'information est recherchée ;
  3. Valider le choix en "cliquant" le search en rouge dans le coin à droite,
  4. Il vous suffit alors de vérifier si l'espèce recherchée figure dans la liste et si c'est le cas les valeurs recherchées apparaîtront en cliquant sur le nom. Notez les valeurs.

 

On peut également interroger la base de données sur d'autres critères que le nom d'un organisme particulier et obtenir des informations plus larges sur les espèces ayant en commun de pousser à telle température, entre telle et telle températures, etc. La sélection se fait alors en renseignant la partie inférieure de l'écran de travail. On pourra ainsi par exemple obtenir la liste de toutes les espèces psychrophiles en "cochant" Growth temperature class:_Psychrophile(<20°C)". Valider le choix en cliquant le search en rouge dans le coin à droite.

Des informations générales sur le contenu de la base de données (nombre d'espèces par catégories de preferendum thermique, des données sur les acides aminés rencontrés dans les protéines en fonction du preferendum thermique, etc.) sont accessibles en sélectionnant statistics dans le bandeau de gauche

Commentaires correspondant à la version en ligne en Juin 2009.