Un indice ribosomique de thermostabilité
Par Hervé Levesque
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Dernière modification
04/07/2016 10:34
Une activité permettant de montrer que la composition en bases azotées d'un ARN (l'ARN ribosomique 16S) est corrélée à la température optimale de croissance de l'organisme qui produit cette molécule.
Nous nous inspirons ici des travaux de Galtier et Lobry (1997) et de ceux du groupe de Manolo Gouy à Lyon.
L'exploitation d'une base de données
Construction des graphiques établissant la relation entre %G+C de l'ensemble (nos propres données) ou de portions double brin (données de Galtier et Lobry, 1997) des ARN ribosomiques et la température optimale de croissance (Topt) de l'organisme.
Etablissement d'un abaque de référence puis mise en application et prédiction sur la thermostabilité d'une espèce dans une épreuve de test
- Il peut par exemple s'agir d'une enquête en milieu hospitalier de germes thermorésistants ou
- d'une évaluation sur du matériel fossile ou
- d'une enquête en répression des fraudes (eau de source thermale ou simple eau du robinet ou de surface...)= fiction à créer.
Une application à la reconstitution des conditions de preferendum thermique pour des espèces ancestrales
Une tentative pour retracer les conditions thermiques dans lesquelles vivait LUCA et quelques autres ancêtres importants (travaux du groupe de manolo Gouy à Lyon).