Les espaceurs et les unités ribosomiques
Les unités ribosomiques sont ainsi qualifiées car, chez les organismes eucaryotes, il s'agit de gènes nucléaires généralement répétés en tandem au sein d'un (ou éventuellement plusieurs) chromosome(s). Cette région des chromosomes est appelée l'organisateur nucléolaire car elle est à l'origine de la formation (selon les cas) d'un (ou plusieurs) nucléole(s). Le nucléole est un compartiment particulier au sein du noyau au niveau duquel sont formés les ribosomes. En effet la transcription des unités ribosomiques produit les ARN ribosomiques qui comme leur nom l'indique sont des constituants des ribosomes.
Les ITS 1 et 2 sont les espaceurs internes transcrits (Internal Transcribed Spacers) dont l'analyse nous intéresse plus particulièrement dans ce dossier. L'IGS est l'espaceur intergénique (InterGenic Spacer) qu'il faut comprendre comme le grand espaceur situé entre les unités codantes (géniques) 18S+5.8S+28S considérées ensemble. L'IGS comprend une portion transcrite (ETS, External Transcribed Spacer) et une portion non transcrite (NTS Non Transcribed Spacer). L'unité de transcription comprend ainsi l'ETS + les séquences codantes pour les trois ARN 18S, 5.8S et 28S + les ITS 1 et 2. La taille de la répétition ADNr est environ de 10 kpb (cette taille varie pour l'ensemble du monde vivant d'environ 5 kpb à plus de 50 kpb). Le nombre de copies de l'unité ribosomique est en général de plusieurs centaines à plusieurs milliers de copies (il varie pour l'ensemble du monde vivant d'une unique copie à plusieurs centaines de milliers de copies).